Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms