Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21870J3QPN2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21870J3QPN2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21870J3QPN2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21870J3QPN2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21870J3QPN2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21870J3QPN2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms