Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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BC024978J3QPC3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC024978J3QPC3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC024978J3QPC3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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BC024978J3QPC3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms