Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim22J3QP37 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms