Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21972J3QN38 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms