Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930544D05RikJ3QK56 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms