Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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