Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pabpc4lG5E8X2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms