Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim55G3X8Y1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim55G3X8Y1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms