Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6F8VPZ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6F8VPZ5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms