Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms