Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm28038F7BCN9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28038F7BCN9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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