Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28048F7BCN0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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