Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm20538F6Z9R1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms