Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms