Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8444F6XS56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms