Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms