Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc7bE9Q9Y3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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