Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga10E9Q6R1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms