Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms