Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC005561E9Q5E2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BC005561E9Q5E2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms