Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zfp558E9Q1J0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp558E9Q1J0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp558E9Q1J0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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