Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3095E9Q058 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3095E9Q058 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms