Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms