Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pkhd1E9PZ36 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms