Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sfta2E9PXB6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms