Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms