Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035044E0CXF8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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BC035044E0CXF8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC035044E0CXF8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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