Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28043E0CXC2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms