Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms