Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm20547B8JJN0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20547B8JJN0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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