Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Phf11bB4XVQ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Phf11bB4XVQ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11bB4XVQ1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms