Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah3B2RWG3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms