Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apba1B2RUJ5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms