Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprbB2RU80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprbB2RU80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms