Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol7aB2RT54 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms