Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms