Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trabd2bB1ATG9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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