Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pramef20B1ARV6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pramef20B1ARV6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pramef20B1ARV6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef20B1ARV6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pramef20B1ARV6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef20B1ARV6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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