Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprsB0V2N1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprsB0V2N1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtprsB0V2N1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprsB0V2N1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms