Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms