Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttll11A4Q9F4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms