Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb1A2AQ07 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms