Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GabreA2AMW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GabreA2AMW3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms