Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam43bA2AM80 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms