Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms