Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp8nlA2ABX0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms