Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm16A2A935 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms