Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm2A2A7B5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm2A2A7B5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms