Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc173A0JLY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms